《交通运输部关于做好新冠病毒疫苗货物运输车辆免费不停车便捷服务工作的通知》中规定,收费公路收费站对持有()的车辆,实施免费、不停车、便捷通行。

这道题考察的是对《交通运输部关于做好新冠病毒疫苗货物运输车辆免费不停车便捷服务工作的通知》内容的理解和记忆。

首先，我们需要明确题目询问的是哪个文件或单据能使新冠病毒疫苗货物运输车辆在收费公路上享受免费、不停车、便捷通行的服务。

接下来，我们逐一分析选项：

A选项（送货单）：送货单通常是货物运输过程中用于证明货物已送达的单据，但它并不特指新冠病毒疫苗的运输，也不具备使其享受特殊通行服务的法律效力，因此可以排除。
B选项（配货单）：配货单主要用于指导货物的装载和配送，同样不特指新冠病毒疫苗的运输，也不符合题目要求的特殊通行条件，故不选。
C选项（证明）：这个选项过于宽泛，没有明确指出是何种性质的证明，无法直接对应到新冠病毒疫苗货物运输的特殊通行政策上，因此也不是正确答案。
D选项（调运单）：根据《交通运输部关于做好新冠病毒疫苗货物运输车辆免费不停车便捷服务工作的通知》的规定，收费公路收费站对持有合法新冠病毒疫苗货物运输调运单的车辆，实施免费、不停车、便捷通行。这直接对应了题目中的要求，因此是正确答案。
E选项（上货单）：上货单通常用于记录货物上车的情况，与新冠病毒疫苗的特殊通行政策无关，故不选。

综上所述，D选项（调运单）是正确答案，因为它直接符合《交通运输部关于做好新冠病毒疫苗货物运输车辆免费不停车便捷服务工作的通知》中的规定。