《安全生产法》规定两个以上生产经营单位在同一作业区域内进行可能危及对方安全生产的生产经营活动未签订安全生产管理协议或者未指定专职安全生产管理人员进行安全检查与协调的责令限期改正可以处()的罚款。

本题考察的是对《安全生产法》相关条款的理解和应用。

首先，我们需要明确题目中的关键信息：两个以上生产经营单位在同一作业区域内进行可能危及对方安全的生产经营活动时，若未签订安全生产管理协议或未指定专职安全生产管理人员进行安全检查与协调，将面临何种处罚。

接下来，我们逐一分析选项：

A. 二万元以上：此选项仅给出了罚款的下限，且该下限高于《安全生产法》规定的上限，因此不正确。

B. 二万元以下：此选项同样只给出了罚款的范围，但范围设定在了一个远低于法定范围的值内，因此也不正确。

C. 五万元以上：此选项只提到了罚款的下限，并且该下限高于法定范围，故不正确。

D. 五万元以下：根据《安全生产法》的相关规定，对于未签订安全生产管理协议或未指定专职安全生产管理人员进行安全检查与协调的，责令限期改正，并可以处五万元以下的罚款。此选项完全符合法律条文的规定。

综上所述，当两个以上生产经营单位在同一作业区域内进行可能危及对方安全的生产经营活动，却未采取必要的安全管理措施时，按照《安全生产法》的规定，应责令其限期改正，并可处以五万元以下的罚款。

因此，正确答案是D。