根据《交通运输部网络安全管理办法》规定运行单位应采取技术措施监测.记录运行状态和网络安全事件留存相关的网络日志不少于()个月。

解析：

本题考察的是对《交通运输部网络安全管理办法》中关于网络日志留存时间规定的理解。

A选项（12个月）：此选项的留存时间虽然较长，但并非《交通运输部网络安全管理办法》中规定的具体时长，故不选。

B选项（18个月）：此选项的留存时间更长，但同样不是该管理办法中针对网络日志留存时间的具体要求，故排除。

C选项（3个月）：此选项的留存时间相对较短，不符合《交通运输部网络安全管理办法》中对于重要网络日志需要较长时间留存以备查证的要求，故不选。

D选项（6个月）：根据《交通运输部网络安全管理办法》的相关规定，运行单位应采取技术措施监测、记录运行状态和网络安全事件，并留存相关的网络日志不少于6个月。这一规定旨在确保在发生网络安全事件时，有足够的日志信息可供追溯和分析，从而有效应对和处置。因此，D选项是正确答案。

综上所述，正确答案是D（6个月）。