3.2.116注册登记查验时,发现打刻的车辆识别代号及其附近可视区域存在局部打磨、涂漆等加工处理痕迹时,无论加工处理痕迹是否影响管理部门对车辆识别代号的识别和认定,应认定为不符合GB7258国家标准的要求。

选项A：正确。这个选项的意思是，无论车辆识别代号（VIN）及其附近可视区域的局部打磨、涂漆等加工处理痕迹是否影响管理部门对车辆识别代号的识别和认定，都应该认为这不符合GB7258国家标准的要求。

选项B：错误。这个选项的意思是，上述情况不一定不符合GB7258国家标准的要求，可能需要根据实际情况判断。

为什么选择答案B： 根据GB7258-2017《机动车运行安全技术条件》的相关规定，车辆识别代号（VIN）应当清晰、牢固，并应在车辆上易于识别和读取的位置。如果车辆识别代号及其附近区域存在局部打磨、涂漆等加工处理痕迹，需要进一步判断这些痕迹是否影响了车辆识别代号的清晰度、完整性和可识别性。如果这些加工处理痕迹不影响管理部门对车辆识别代号的识别和认定，那么就不能简单地认定为不符合国家标准。

因此，正确答案是B。这是因为题干中的表述“无论加工处理痕迹是否影响管理部门对车辆识别代号的识别和认定”是一个绝对的说法，而实际上标准中是有条件限定的，即需要判断这些痕迹是否影响了车辆识别代号的识别。如果痕迹不影响识别，则不应直接认定为不符合标准。