《中华人民共和国食品安全法》规定，国家建立（ ），运用科学方法，根据食品安全风险监测信息、科学数据以及有关信息，对食品、食品添加剂、食品相关产品中生物性、化学性和物理性危害因素进行风险评估。

这道题目考察的是对《中华人民共和国食品安全法》中关于国家建立的食品安全管理机制的理解。我们来逐一分析每个选项： A. **风险分级管理制度**：这个制度主要是指根据食品生产经营者的食品安全状况，将其分为不同的等级，并采取相应的监管措施。虽然这也是食品安全管理中的一个重要组成部分，但并不是题干所描述的内容。 B. **食品安全风险监测制度**：这项制度是指通过持续地收集、分析和报告有关食品中可能存在的有害因素的数据，以识别潜在的食品安全问题。它是进行食品安全风险评估的基础之一，但并不直接等同于“运用科学方法对食品中的危害因素进行风险评估”。 C. **食品安全标准**：这是指为了保障公众健康而设定的一系列技术要求或规范，包括但不限于食品添加剂的最大使用量、污染物限量等。它为食品安全提供了具体的衡量标准，但与题干提到的风险评估过程不完全一致。 D. **食品安全风险评估制度**：正确答案。该制度正是指国家依据食品安全风险监测信息及其他相关资料，采用科学手段对食品及其相关产品中存在的生物性、化学性和物理性危害因素进行全面评价的过程。这与题目描述完全吻合。 因此，根据题意，《中华人民共和国食品安全法》规定国家建立的是**食品安全风险评估制度**（选项D），用以科学地评估食品中可能存在的各种类型的安全隐患。