根据《公安机关办理行政案件程序规定》的规定，办理行政案件中，公安机关负责人的回避，由（）决定。

这是一道涉及《公安机关办理行政案件程序规定》的法律知识题，需要准确理解公安机关在办理行政案件时，各级负责人的回避决定权归属。

首先，我们梳理题干中的关键信息：本题考察的是公安机关负责人在办理行政案件中的回避决定权归属。

接下来，我们逐一分析选项：
A项：案件当事人：案件当事人是案件的直接参与者，他们有权申请回避，但并无权决定回避。因此，A项错误。

B项：所属公安机关：虽然所属公安机关在行政案件办理中扮演重要角色，但根据《公安机关办理行政案件程序规定》，公安机关负责人的回避并不由其所属公安机关决定。故B项错误。

C项：所属公安机关党委：公安机关党委主要负责党的建设和思想政治工作，不直接参与案件的具体办理和决定程序，因此不承担公安机关负责人的回避决定权。C项错误。

D项：上一级公安机关：根据《公安机关办理行政案件程序规定》第二十五条：“公安机关负责人、办案人民警察的回避，由其所属的公安机关决定；公安机关负责人的回避，由上一级公安机关决定。” 这一规定明确指出了公安机关负责人在办理行政案件中的回避决定权归属上一级公安机关。因此，D项正确。

综上所述，公安机关负责人在办理行政案件中的回避决定权应由上一级公安机关决定，因此答案是D。