计算机系统由两大部分构成，它们是（ ）。

**解析：** 计算机系统是一个复杂的整体，从逻辑结构上看，它主要由**硬件系统**和**软件系统**两大部分组成，二者相辅相成，缺一不可。 1. **硬件系统（Hardware System）**： 是指计算机中由电子、机械和光电元件等组成的各种物理装置的总称。它是计算机运行的物质基础。通常包括运算器、控制器、存储器、输入设备和输出设备五大部件（即冯·诺依曼体系结构）。 * 选项 B（主机和外部设备）和选项 D（输入设备和输出设备）均只是硬件系统的组成部分或分类方式，不能代表整个计算机系统。 2. **软件系统（Software System）**： 是指为了运行、维护、管理和应用计算机所编制的所有程序、数据和文档的总和。软件是计算机的灵魂，它指挥硬件完成各种任务。软件系统通常分为系统软件（如操作系统）和应用软件（如办公软件）。 * 选项 A（系统软件和应用软件）仅是软件系统的分类，忽略了硬件部分，因此不完整。 **综上所述：** 只有**硬件系统**和**软件系统**结合，才能构成一个完整的、可工作的计算机系统。硬件提供物理支持，软件提供逻辑指令，两者共同作用。 因此，正确答案是 **C**。