设置入河排污口的单位，向有管辖权的县级以上地方人民政府水行政主管部门或者流域管理机构提出入河 排污口设置申请之后，还应当在向环境保护行政主管部门报送。（）

题目中提到的是关于设置入河排污口的相关程序。根据中国的环保法律法规，在设置入河排污口之前，需要经过一定的审批流程。题目的核心在于了解在提交入河排污口设置申请后，接下来还需要向环保部门提交什么文件。

选项分析：
A. 建设项目申请 - 这通常是指建设项目的立项申请，并不是直接与排污口设置相关的文件。
B. 建设项目申请 - 这里重复了一次选项A的内容，但从上下文来看，正确的表述应该是“建设项目环境影响评价文件”，即建设项目报告书。
C. 取水许可申请 - 这是针对从河流等水源取水的行为，而不是排污行为。
D. 建设项目报告书 - 实际上应该指的是建设项目环境影响评价报告书，这是建设项目环评的一部分，通常包含对建设项目可能造成的环境影响的评估。

正确答案应为：D. 建设项目报告书。但是题目中的答案给的是B，这可能是印刷错误或题库中的误标。实际上，在向环保部门提交材料时，应当提交的是与建设项目环境影响评价相关的文件，也就是所谓的建设项目报告书。

因此，尽管题库中的答案显示为B，正确的理解和选择应该是D。在实际考试中，如果遇到类似的错误，应当根据最新的法律法规以及逻辑判断来做出选择。