经批准的规划需要修改时，必须按照规划编制程序经（）批准。

解析：

本题考察的是水利工程规划修改的批准程序。

A选项：（A）原批准机关。在水利工程规划中，如果已经批准的规划需要修改，根据相关的行政程序和法规，这样的修改必须遵循原规划的编制和批准程序，即需要由原批准机关进行审查和批准。这是为了确保规划的连续性和权威性，避免规划频繁变动带来的不良影响。

B选项：（B）水行政主管部门。虽然水行政主管部门在水利工程规划和管理中扮演着重要角色，但它们并不直接负责已批准规划的修改批准工作。这类修改通常需要更高层次的审批机构来决策。

C选项：（C）上级部门。在行政体系中，上级部门可能对下级部门的工作进行指导和监督，但并不直接负责下级部门所制定和批准的规划的修改工作。这类修改通常需要遵循特定的程序和渠道。

D选项：（D）同级人民政府。同级人民政府主要负责本行政区域内的综合管理和服务工作，虽然可能对水利工程规划有所了解和关注，但并不直接负责已批准规划的修改批准工作。

综上所述，经批准的规划需要修改时，必须按照规划编制程序经原批准机关批准，以确保规划的严肃性和权威性。因此，正确答案是A选项：（A）原批准机关。