在江河、湖泊新建、改建或者扩大排污口，应当经过有管辖权的（）部门或者流域管理机构同意，由环 境保护行政主管部门负责对该建设项目的环境影响报告书进行审批。

选项解析：

A. 行政主管：这一选项过于宽泛，没有明确指出具体负责的部门，行政主管可能涉及多个领域，不特指水利或环境保护。

B. 水行政主管部门：这一选项正确。根据中国的相关法律法规，如《中华人民共和国水污染防治法》等，江河、湖泊新建、改建或者扩大排污口的审批属于水行政主管部门的职责范围。水行政主管部门负责水域保护和污染防治工作，因此，新建或改建排污口需要得到其同意。

C. 有关主管：这一选项同样过于模糊，没有明确指出具体的主管部门，不能准确反映负责审批的具体部门。

D. 发展与改革：发展与改革部门通常负责宏观的经济社会发展规划和改革措施，不直接负责具体的环境影响审批工作。

选择答案B的理由：

依据《中华人民共和国水污染防治法》等相关法律法规，涉及江河、湖泊等水体的排污口的新建、改建或扩大，需要由水行政主管部门审批。这是因为水行政主管部门具有对水域使用和保护的专门管理权限，能够确保相关活动不会对水资源造成不利影响。环境保护行政主管部门则负责对建设项目的环境影响报告书进行审批，但前提是必须得到水行政主管部门的同意。因此，正确答案是B（水行政主管部门）。