甲流域为羽状水系，乙流域为扇状水系，其他流域下垫面因素和气象因素均相同，对相同的短历时暴雨所形成的流量过程，甲流域的洪峰流量比乙流域的（）。

这个问题涉及到水文学中关于水系形态对洪水过程影响的理解。首先，我们来分析题目中的关键信息：

甲流域为羽状水系
乙流域为扇状水系
其他流域下垫面因素和气象因素均相同
对相同的短历时暴雨

接下来，我们分析各个选项：

A. 洪峰流量大：羽状水系（甲流域）的特点是支流多且向干流汇流的角度较大，这通常会导致洪水在干流中汇集时，由于各支流汇流时间较为接近，可能会形成较大的洪峰流量。然而，在本题中，由于其他流域下垫面因素和气象因素均相同，且是短历时暴雨，因此洪峰流量的大小更多地取决于降雨的强度和持续时间，而非水系形态。故A选项不正确。

B. 洪峰流量小：虽然水系形态对洪峰流量有一定影响，但在此特定情境下（其他条件相同，短历时暴雨），水系形态不是决定性因素。然而，从另一角度考虑，扇状水系（乙流域）的支流多且分布较广，可能使得洪水在干流上的汇集更为分散，从而在相同降雨条件下，可能形成相对较小的洪峰流量。但更准确的解释是，由于问题主要关注的是水系形态对洪水过程的影响，而非直接比较两个流域的洪峰流量大小，且题目并未提供足够信息来直接判断洪峰流量的大小，因此这里选择B选项更多是基于水系形态特点和题目设问方式的综合考虑。但严格来说，B选项并非直接由题目信息得出，而是基于一种可能的推论。然而，在四个选项中，B选项与题目描述的情境最为吻合。

C. 峰现时间早：羽状水系由于其支流向干流汇流的角度较大，理论上可能会导致洪水在干流上的汇集更为迅速，但在这个问题中，由于降雨是短历时的，且其他条件均相同，因此水系形态对峰现时间的影响相对有限。更重要的是，题目并未直接询问峰现时间的早晚，而是询问了洪峰流量和峰现时间的相对关系。因此，C选项不正确。

D. 峰现时间晚：扇状水系由于其支流分布较广，洪水在干流上的汇集需要更长时间。在短历时暴雨的情况下，这种水系形态可能导致洪水在干流上的汇集相对较慢，从而形成较晚的峰现时间。这与题目描述的情境相符，因此D选项是正确的。

综上所述，虽然B选项在严格意义上可能不是直接由题目信息得出的结论，但考虑到水系形态对洪水过程的一般影响以及题目设问的方式，B选项（洪峰流量小）和D选项（峰现时间晚）都是合理的答案。然而，在单选题的情境下，我们更倾向于选择D选项（峰现时间晚），因为它更直接地回应了题目中关于水系形态对洪水过程影响的询问。同时，也需要注意到，这种选择在一定程度上是基于对水系形态和洪水过程之间关系的理解和推断。