特别行政区行政机关的主要官员（澳门特别行政区还包括司法机关的检察长）由行政长官提名并报请以下何者任命？

答案解析：D:中央人民政府

在特别行政区，行政长官是由中央人民政府任命的。特别行政区的行政长官是特别行政区的最高行政长官，负责领导特别行政区的行政工作。行政长官提名特别行政区行政机关的主要官员，并报请中央人民政府任命。

举个例子来帮助理解：就好比在一个大家庭里，家长是最高领导者，负责管理家庭的日常事务。家长会提名家庭中的重要职位，比如家庭的财务主管或者家庭的规划者，并且需要得到家长的同意才能正式任命。在特别行政区中，中央人民政府就像是家长，行政长官就像是家庭的领导者，负责管理特别行政区的事务，提名重要官员需要得到中央人民政府的认可和任命。这样就能更好地理解特别行政区的行政机构是如何运作的。