直线定向时，标准方向有真子午线方向、（）。

这是一道关于直线定向中标准方向选择的问题。我们需要从给定的选项中找出哪些方向是直线定向时的标准方向。

首先，理解题目背景：在水利工程或地理测绘中，直线定向是确定一条直线与某一标准方向之间角度关系的过程。这些标准方向是固定的，用于作为测量的基准。

接下来，我们逐一分析选项：

A. 磁子午线方向：磁子午线方向是指地球磁极确定的子午线方向，它是通过指南针等磁性测量工具来确定的。在直线定向中，磁子午线方向是一个重要的标准方向，因为它可以通过简单的磁性测量获得，且在全球范围内都有应用。因此，A选项是正确的。

B. Y 轴方向：在二维坐标系中，Y轴方向是垂直于X轴的一个方向。然而，在直线定向的语境下，Y轴方向并不是一个固定的、全球统一的标准方向。它依赖于具体的坐标系设定，且不具有普遍适用性。因此，B选项是错误的。

C. 坐标纵轴方向：在地理坐标系或工程坐标系中，坐标纵轴（通常称为X轴）方向往往与真子午线方向或磁子午线方向有一定的关联或对应关系。在某些情况下，坐标纵轴方向可以直接作为直线定向的标准方向，或者通过简单的转换得到标准方向。因此，C选项也是正确的，尽管它可能不是直接的真子午线或磁子午线方向，但可以作为相关或等效的标准方向。

D. 坐标横轴方向：与Y轴方向类似，坐标横轴（通常称为Y轴）方向在直线定向中并不是一个固定的、全球统一的标准方向。它同样依赖于具体的坐标系设定，且不具有普遍适用性。因此，D选项是错误的。

综上所述，正确答案是A（磁子午线方向）和C（坐标纵轴方向），因为它们都是直线定向时可能采用的标准方向。而B（Y轴方向）和D（坐标横轴方向）则不是直线定向的标准方向。