《国务院关于印发“十四五”节能减排综合工作方案的通知》中指出加快公共机构既有建筑围护结构、供热、制冷、照明等设施设备节能改造，鼓励采用能源费用托管等合同能源管理模式，属于（）工程。

解析

本题考察的是对《国务院关于印发“十四五”节能减排综合工作方案的通知》中内容的理解和应用。

首先，我们来分析题目中的关键信息：题目提到“加快公共机构既有建筑围护结构、供热、制冷、照明等设施设备节能改造，鼓励采用能源费用托管等合同能源管理模式”。这里明确指出了“公共机构”和“节能改造”两个核心点。

接下来，我们逐一分析选项：

A. 公共机构能效提升：

这个选项直接对应了题目中提到的“公共机构既有建筑”的“节能改造”。题目中描述的内容，包括围护结构、供热、制冷、照明等设施的节能改造，以及采用能源费用托管等合同能源管理模式，都是为了提升公共机构的能效。因此，这个选项与题目描述高度吻合。

B. 煤炭清洁高效利用：

这个选项主要关注的是煤炭的清洁和高效利用，与题目中提到的公共机构建筑节能改造和合同能源管理模式无直接关联。因此，可以排除。

C. 农业农村节能减排：

这个选项关注的是农业农村领域的节能减排，与题目中提到的公共机构建筑节能改造不符。因此，不是正确答案。

D. 重点区域污染物减排：

这个选项关注的是重点区域的污染物减排，与题目描述的公共机构建筑节能改造没有直接联系。因此，也可以排除。

综上所述，根据题目描述和各个选项的对比分析，可以确定答案为A项“公共机构能效提升”。这个选项最准确地反映了题目中提到的公共机构建筑节能改造和采用合同能源管理模式的措施。