《中国共产党普通高等学校基层组织工作条例》明确,高等学校实行( ).

选项A：“党委领导下的校务委员会负责制”错误，因为《中国共产党普通高等学校基层组织工作条例》中并没有提及校务委员会负责制，在实际的高校管理中，党委领导下的校长负责制是明确的领导体制。

选项B：“党委领导下的校长分工负责制”描述不准确，校长分工负责制没有体现出校长在行政工作中的统一领导作用，而《条例》明确的是校长在党委领导下负责学校的行政工作。

选项C：“党委领导下的校长负责制”正确，这是《中国共产党普通高等学校基层组织工作条例》中明确规定的高等学校实行的领导体制。在这一体制下，学校党委是学校的领导核心，统一领导学校工作，而校长在党委领导下，主持学校的行政工作。

选项D：“党委领导下的校长负责制和校长负责制并存”错误，因为这种表述会造成体制上的混淆，实际上《条例》明确了是党委领导下的校长负责制，而非两种体制并存。

因此，正确答案是C：“党委领导下的校长负责制”，这是因为这一选项符合《中国共产党普通高等学校基层组织工作条例》的相关规定，准确反映了我国高等学校的领导体制。