社会主义市场经济的根本特殊性在于

这是一道定义判断类型的问题，我们需要分析社会主义市场经济的根本特殊性，并从给定选项中选择最符合题意的答案。

首先，理解题目中的关键信息：社会主义市场经济的“根本特殊性”。这要求我们识别出哪个选项最能体现社会主义市场经济与其他市场经济形式（如资本主义市场经济）的本质区别。

接下来，分析各个选项：
A选项（国家有计划地调节市场活动）：虽然国家调节市场活动在多种经济体制下都存在，但它不是社会主义市场经济的独特特征。资本主义国家也会通过政策手段调节市场。

B选项（国家制定完整法律规范市场活动）：制定法律规范市场活动是任何现代市场经济体制的普遍做法，不仅限于社会主义市场经济。

C选项（国家直接参与市场活动）：国家在某些情况下可能会参与市场活动，但这同样不是社会主义市场经济的独特标志。在特定条件下，其他国家也可能采取类似做法。

D选项（它是同社会主义基本制度结合在一起的）：这个选项直接指出了社会主义市场经济的根本特殊性。社会主义市场经济是与社会主义基本制度紧密相连的，这意味着它在所有制结构、分配制度、宏观调控等方面都体现了社会主义的原则和特点，这是与其他市场经济形式（如资本主义市场经济）的本质区别。

综上所述，D选项最准确地描述了社会主义市场经济的根本特殊性，即它与社会主义基本制度的紧密结合。
因此，答案是D。