任何相对于公司内已生效的GMP文件的偏离即属偏差。

题目解析：任何相对于公司内已生效的GMP文件的偏离即属偏差。这是正确的。GMP（Good Manufacturing Practice，良好生产规范）是指在制药、食品、医疗器械等行业中，为确保产品的质量和安全性，制定的一系列规范和标准。如果某个操作或行为与公司内已生效的GMP文件不符合，即存在偏离，就可以称之为偏差。因此，答案为A，正确。