建设工程项目部应根据建筑工程规模配备专职安全管理人员，建筑面积在5万平方米以上的工程应配备（ ）。

根据《建筑施工企业安全生产管理机构设置及专职安全生产管理人员配备办法》的相关规定，建筑工程、装修工程按照建筑面积配备专职安全生产管理人员的标准如下： 1. **1万平方米以下**的工程，至少配备 **1名** 专职安全生产管理人员； 2. **1万～5万平方米** 的工程，至少配备 **2名** 专职安全生产管理人员； 3. **5万平方米以上** 的工程，至少配备 **3名** 专职安全生产管理人员，且应当按专业配备专职安全生产管理人员。 题目中指出该工程建筑面积在 **5万平方米以上**，因此应配备不少于3人的专职安全管理人员。 故正确答案为 **C**。