331.实行施工总承包的,( )应当与安装单位签订建筑起重机械安装、拆卸工程安全协议书。

这是一道关于建筑施工安全责任归属的问题。我们需要根据题目描述和选项内容，结合建筑施工安全管理的相关规定，来判断哪个选项是正确的。

首先，理解题目背景：题目提到的是实行施工总承包的情况下，哪个单位应与安装单位签订建筑起重机械安装、拆卸工程安全协议书。

接下来，分析各个选项：

A选项（出租单位）：虽然出租单位提供了起重机械，但在此情境下，其并不直接负责安装和拆卸工作，因此不是签订安全协议书的主体。
B选项（检验检测机构）：检验检测机构主要负责起重机械的检验和检测工作，以确保其安全性，但并不参与安装和拆卸过程，因此也不是签订安全协议书的主体。
C选项（施工总承包单位）：施工总承包单位在项目中承担全面管理责任，包括确保施工安全。在安装和拆卸起重机械这一高风险作业中，施工总承包单位需要与安装单位明确安全责任，因此是签订安全协议书的合适主体。
D选项（使用单位）：虽然使用单位会最终使用起重机械，但在安装和拆卸阶段，其并不直接负责这些工作，因此不是签订安全协议书的主体。

综上所述，施工总承包单位在项目中承担全面管理责任，需要确保包括起重机械安装、拆卸在内的所有施工活动的安全性。因此，施工总承包单位应与安装单位签订建筑起重机械安装、拆卸工程安全协议书，以明确双方的安全责任。

因此，正确答案是C（施工总承包单位）。