银行业金融机构清分中心在银行业金融机构网点缴存的现金中发现假币，假币实物由（ ）直接收缴。

**解析：** 根据《中国人民银行货币鉴别及假币收缴、鉴定管理办法》及相关银行业金融机构现金处理规定： 1. **清分中心的职责与权限**：银行业金融机构设立的清分中心（或集中清分点）具备独立的假币识别和收缴职能。当清分中心在对网点缴存的现金进行清分处理时，如果发现假币，应当由**清分中心**直接按照法定程序进行收缴。 2. **收缴流程**：清分中心发现假币后，应双人复核，确认无误后予以收缴，加盖“假币”印章，并出具《假币收缴凭证》。同时，需要向当地人民银行分支机构报告，并按规定上缴假币实物，但直接的收缴行为主体是清分中心。 3. **排除其他选项**： * A项：上级部门不直接参与具体的现金清分和现场收缴操作。 * C项和D项：人民银行及其分支机构是监管机构和最终的真伪鉴定机构，负责接收金融机构上缴的假币，但不直接代替金融机构进行日常的现金清分和现场收缴工作。 因此，假币实物由**清分中心**直接收缴。 故正确答案为 **B**。