银行业金融机构对于查询人提供的冠字号码查询申请证明材料不完备的，应（ ）。

**解析：** 根据《中国人民银行货币鉴别及假币收缴、鉴定管理办法》及银行业金融机构冠字号码查询相关管理规定，银行业金融机构在受理冠字号码查询申请时，应当对申请人提供的证明材料进行审核。 1. **审核义务**：银行工作人员需要核实查询人提供的有效证件、办理取款业务的证明资料（如银行卡、存折、取款凭证等）以及填写的《人民币冠字号码查询申请表》是否齐全、有效。 2. **材料不完备的处理**：如果查询人提供的证明材料不完备，金融机构**不得直接拒绝**（排除 A），也**不能在材料缺失的情况下正常受理**（排除 B），更**不得违规收取费用**（排除 C，冠字号码查询通常是免费服务）。 3. **正确做法**：金融机构应当**当面告知**查询人需要补齐的相关材料，待材料齐全后予以受理。这体现了金融服务的服务性和规范性，保障了消费者的合法权益。 因此，正确答案是 **D**。