下列案件应由公安机关立案侦查的是（）

这个题目考察的是对不同案件性质以及管辖权的理解。 题目的核心在于识别哪一种案件应当由公安机关立案侦查。根据我国法律的规定，公安机关主要负责刑事案件的立案、侦查等工作。具体分析如下： A选项：刘某直接经营管理的采矿企业发生重大责任事故案。这类案件通常涉及生产安全事故，属于公安机关的管辖范围。因为这类事故可能涉及到重大责任事故罪，属于刑法调整范畴，应由公安机关负责侦查。 B选项：甲县公安机关民警刘某对审讯过程中拒不交代问题的抢劫犯罪嫌疑人王某进行殴打。这种情况属于公安内部的违法违纪行为，一般由上级公安机关或监察机关处理，而不是公安机关自己立案侦查。 C选项：某国企总经理蔡某侵占企业经营款项20万元。这种案件属于职务侵占罪，虽然也是刑事案件，但通常由检察机关直接介入调查，而不一定是由公安机关立案侦查。 D选项：甲县国税局局长对于其拥有的200万元存款无法说明来源。这种情况涉及巨额财产来源不明的问题，通常由纪检监察部门调查，而不是公安机关直接立案侦查。 综上所述，正确答案是A选项，即“刘某直接经营管理的采矿企业发生重大责任事故案”应由公安机关立案侦查。 最终答案是A。