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当进水原液中含有有毒物质，容易导致微生物大量死亡，污泥量减少。可以通过长时间驯化，使微生物能够适应污染物质，如果长期驯化难以适应有毒物质，通过增加预处理系统或者对进水进行稀释处理
当进水负荷降低，系统营养物质不足，难以满足微生物生存条件时，导致系统微生物自身分解，污泥量减少。可以通过增加系统的进水量来弥补系统的负荷的降低或者可以添加碳源来保证系统微生物的营养物质
污泥浓度增加，容易导致系统污泥沉降比升高，此时可以通过排泥降低系统微生物数量，以降低沉降比
污泥膨胀引起的污泥松散，沉降效果不佳。可通过添加杀菌剂消除丝状菌的生长，防止其抑制其他微生物的生长；在杀菌剂依然难以起到抑制污泥膨胀的效果的时候，需要将生化系统排空，重新投加污泥进行培养
渗滤液碳氮比失衡，缺少微量元素，阻碍微生物的正常生长，导致污泥沉降比上升，沉降速率下降。针对微生物缺少的营养物质以及微量元素进行添加
系统超负荷运行，导致系统运行水质发生变化，导致微生物中毒，严重影响微生物的活性，沉降性能下降。可通过降低系统运行负荷，增加渗滤液在系统的停留时间，并且及时调节其他微生物控制因素，如溶解氧、PH 等
系统曝气量过大，导致系统微生物发生过氧化，污泥难以形成絮体，沉降速率下降，沉降比升高。可通过减小系统曝气量，同时调整系统进水负荷，保证系统的运行水质正常
当好氧系统曝气量不够导致系统溶解氧降低，亚硝态氮难以转化成硝态氮，导致亚硝态氮累积，氨氮去除效率降低，导致氨氮浓度升高。可通过增加系统曝气量，保证硝化系统的溶解氧，减少系统处理量，增加渗滤液在系统的停留时间，来调整该情况
污泥氨中毒系统氨氮维持高浓度运行，由于氨氮本身是有毒物质，导致微生物氨中毒，抑制微生物生长，可以减少系统进水，或者对系统用水进行稀释，降低系统内的氨氮浓度，再重新培养
碳氮比失衡导致系统酸化，系统 PH 值降低，影响氨氮的硝化效果。需要向系统添加碱性物质进行调节，如果碳氮比长期失衡，需要考虑改善水质碳氮比，并且长期添加碱性物质
