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pH过碱过酸导致系统环境发生变化，均会抑制微生物生长，导致微生物数量减少，此时需要通过添加酸性物质或者碱性物质来调节系统的pH值
进水原液碳氮失衡，异养细菌生长受到限制，并且自身分解，导致系统微生物数量减少。需要添加碳源补充微生物营养物质。并且通过添加碱性物质调节系统的 pH 值
进水负荷超过微生物所承受的负荷，抑制微生物生长，并且造成微生物死亡，污泥量减少。 当进水水质升高时，需要降低系统处理水量，保证系统的处理负荷
当进水原液中含有有毒物质，容易导致微生物大量死亡，污泥量减少。可以通过长时间驯化，使微生物能够适应污染物质，如果长期驯化难以适应有毒物质，通过增加预处理系统或者对进水进行稀释处理
当进水负荷降低，系统营养物质不足，难以满足微生物生存条件时，导致系统微生物自身分解，污泥量减少。可以通过增加系统的进水量来弥补系统的负荷的降低或者可以添加碳源来保证系统微生物的营养物质
污泥浓度增加，容易导致系统污泥沉降比升高，此时可以通过排泥降低系统微生物数量，以降低沉降比
污泥膨胀引起的污泥松散，沉降效果不佳。可通过添加杀菌剂消除丝状菌的生长，防止其抑制其他微生物的生长；在杀菌剂依然难以起到抑制污泥膨胀的效果的时候，需要将生化系统排空，重新投加污泥进行培养
渗滤液碳氮比失衡，缺少微量元素，阻碍微生物的正常生长，导致污泥沉降比上升，沉降速率下降。针对微生物缺少的营养物质以及微量元素进行添加
系统超负荷运行，导致系统运行水质发生变化，导致微生物中毒，严重影响微生物的活性，沉降性能下降。可通过降低系统运行负荷，增加渗滤液在系统的停留时间，并且及时调节其他微生物控制因素，如溶解氧、PH 等
系统曝气量过大，导致系统微生物发生过氧化，污泥难以形成絮体，沉降速率下降，沉降比升高。可通过减小系统曝气量，同时调整系统进水负荷，保证系统的运行水质正常
