我国项目监理机构在工程勘察设计阶段投资控制的主要工作有( ).

解析:本题考查的是我国项目监理机构在建设工程投资控制中的主要工作。
工程勘察设计阶段投资控制的主要工作有:
(1)协助建设单位编制工程勘察设计任务书和选择工程勘察设计单位,并应协助签订工程勘察设计合同。
(2)审核勘察单位提交的勘察费用支付申请表,以及签发勘察费用支付证书。
(3)审核设计单位提交的设计费用支付申请表,以及签认设计费用支付证书。
(4)审查设计单位提交的设计成果,并应提出评估报告。
(5)审查设计单位提出的新材料、新工艺、新技术、新设备在相关部门的备案情况。必要时应协助建设单位组织专家评审。
(6)审查设计单位提出的设计概算、施工图预算,提出审查意见。
(7)分析可能发生索赔的原因,制定防范对策。
(8)协助建设单位组织专家对设计成果进行评审。
(9)根据勘察设计合同,协调处理勘察设计延期、费用索赔等事宜。
选项E属于施工阶段投资控制的主要工作。