党的十六大以来,全国铁路系统用()统领各项工作,加快推进铁路现代化建设,开创了铁路改革发展的新局面.

**解析：** 本题考查的是中国铁路发展历史中的指导思想。 1. **时间背景分析**：题目明确指出时间是“党的十六大以来”。中国共产党第十六次全国代表大会于2002年召开。在此之后，以胡锦涛同志为总书记的党中央提出了**科学发展观**等重大战略思想。 2. **核心指导思想**：在党的十六大至十八大期间（2002年-2012年），全国铁路系统深入贯彻落实中央部署，明确坚持以**科学发展观**统领铁路工作全局。这一指导思想强调了全面、协调、可持续的发展，推动了铁路在体制机制改革、技术创新、大规模建设等方面取得显著成就，从而开创了铁路改革发展的新局面。 3. **选项辨析**： * **A. 科学发展观**：符合题干所述的历史时期和统领地位，是当时各项工作的根本指导方针。 * **B. 自主创新**：这是铁路发展的重要动力和手段（如高铁技术的引进消化吸收再创新），但不是统领各项工作的最高指导思想。 * **C. 和谐铁路**：这是铁路部门在特定时期提出的建设目标或理念（构建和谐社会在铁路领域的体现），属于具体实践层面，而非统领全局的理论体系。 * **D. 服务优质**：这是铁路工作的具体要求和服务标准，不属于宏观指导思想。 综上所述，党的十六大以来，全国铁路系统是用**科学发展观**统领各项工作。 故正确答案为 **A**。