改建公路时,施工单位应当在施工路段两端设置明显的()。

这是一道关于公路改建时施工单位应设置哪些标志的问题。我们需要根据公路交通管理的相关规定和常识，来判断哪个或哪些选项是正确的。

首先，我们逐项分析各个选项：
A. 施工标志：在公路改建或施工期间，施工单位必须在施工路段两端设置明显的施工标志。这是为了告知过往车辆和行人，前方路段正在施工，需要注意行车安全或绕道行驶。因此，这个选项是正确的。

B. 安全标志：安全标志通常用于指示潜在的危险或需要特别注意的安全事项。在公路改建过程中，设置安全标志是为了确保施工区域和周边道路的安全，防止交通事故的发生。这个选项也是正确的。

C. 警告标志：警告标志主要用于提示驾驶员注意前方道路可能出现的危险情况，如急弯、陡坡、窄桥等。然而，在公路改建的情况下，仅仅设置警告标志可能不足以充分告知施工信息，因此这个选项相比A和B来说，不是最直接相关的。

D. 辅助标志：辅助标志是附设在主标志下，起辅助说明作用的标志。它通常不能单独使用，而是配合主标志一起发挥作用。在公路改建的场景中，辅助标志可能不是必要的，也不是最直接的告知方式。

综上所述，施工单位在改建公路时，最需要在施工路段两端设置的是能够明确告知施工信息的标志，即施工标志和安全标志。这两个标志能够最直接地提醒过往车辆和行人注意施工情况，确保交通安全。

因此，正确答案是A和B。