通行省中心按规定时间上传ETC门架汇总记录但出口省未在规定时间内上传出口交易记录的进入()流程处理。

这道题目考察的是ETC（电子不停车收费系统）交易处理流程中的特殊情况处理。

解析如下：

A. 交易清分业务：这是指将交易数据按照规则进行归类和结算的过程，并不是专门处理数据不匹配或缺失的情况。
B. 交易拆分业务：这是将一笔完整的交易拆分成涉及多个参与方的部分，以进行费用分配，也不是专门针对数据上传不同步的问题。
C. 交易对账业务：当出现一方已上传数据而另一方未按时上传相关数据时，需要通过交易对账来解决数据的一致性问题，确保交易信息完整准确。
D. 退费补交业务：这通常是指处理因误收或多收造成的退款，或是因欠费而需追缴费用的情况，与本题描述的情形不符。

根据题目描述，在这种情况下，由于入口（或称通行）信息已经上传，但出口信息未能及时上传，导致了数据不一致，因此需要通过“交易对账业务”来处理此类问题，确保最终能够正确完成交易记录的匹配和结算。

所以正确答案是 C. 交易对账业务。