通行费收费按各省级人民政府批准的标准执行,对所有通行车辆实行()。

本题考察的是对通行费收费方式的理解。

解析各个选项：
A. 分段收费：这个选项通常不直接用于描述高速公路或类似道路的通行费收费方式。分段收费可能意味着在多个不同路段上分别收费，但这并不直接对应通行费的计算方式。

B. 分段计费：这是指根据车辆行驶的实际路段和距离，按照相应的费率进行计费。在ETC（电子不停车收费）系统中，这通常是通过沿途的门架系统来实现的，每个门架记录车辆经过的里程，并据此计算费用。这种方式既公平又准确，是当前高速公路等收费道路常用的计费方式。

C. 门架扣费：这个选项描述的是扣费的一个环节或设备，即门架系统，但它并不直接描述计费的方式。门架是ETC系统中用于记录车辆行驶信息和扣费的重要设备，但并非计费方式的直接描述。

D. 路段收费：虽然路段收费是通行费的一种形式，但它更侧重于描述收费的范围或单位，即按照不同的路段来收费。然而，这并不直接描述如何计算这些费用，即计费的方式。

综上所述，选项B“分段计费”最准确地描述了通行费按车辆行驶的实际路段和距离进行计费的方式，这是符合当前高速公路等收费道路实际情况的。因此，正确答案是B。