1. (1) 主要依据: 营养菌丝的形态、子实体的类型、结构、繁殖方式等。(2) 鞭毛菌亚门、接合菌亚门、子囊菌亚门、担子菌亚门、半知菌亚门等。(3) 鞭毛菌亚门, 菌丝无横隔, 具单鞭毛游动孢子, 有性生殖产生二倍体的休眠孢子。接合菌亚门, 菌丝无横隔, 生殖细胞无再有鞭毛, 无性生殖产生孢囊孢子, 分生孢子, 有性生殖为异宗接合生殖, 产生接合子孢子, 具多个二倍体的合子核。子囊菌亚门, 为多细胞有机体, 菌丝有隔, 无性生殖产生分生孢子, 有性生殖通过钩状体过程产生子囊、子囊孢子, 有时形成子囊果。担子菌亚门, 菌丝有隔, 菌丝体有三种类型, 初生、次生、三生菌丝体, 双核菌丝体生活周期较长, 并常有锁状连合现象, 有性生殖产生担子、担孢子, 有时形成担子果。半知菌亚门, 尚未发现有性生殖阶段的真菌, 无性生殖时产生分生孢子。