在高层建筑的高度超过（ ）米以上的交叉作业中，应设双层保护设施。

本题考察的是高层建筑交叉作业中的安全保护措施要求。

选项A，12米：这个高度在高层建筑中相对较低，通常不需要设置双层保护设施。因此，A选项不符合题意。

选项B，18米：虽然比12米高，但在高层建筑交叉作业的安全规范中，这个高度也还未达到需要设置双层保护设施的标准。故B选项错误。

选项C，24米：在高层建筑中，当作业高度超过24米时，由于高度增加带来的风险也相应增大，因此需要更为严格的安全防护措施。根据相关规定，超过24米高度的交叉作业应设双层保护设施，以确保作业人员的安全。因此，C选项正确。

选项D，30米：虽然30米高度远超24米，但题目要求的是“超过多少米以上的交叉作业中应设双层保护设施”，而24米已是这一标准的临界值。超过24米即应满足该要求，无需特别指出30米。故D选项虽然在高度上更高，但并不直接对应题目要求。

综上所述，正确答案是C，即在高层建筑的高度超过24米以上的交叉作业中，应设双层保护设施。