2.1.71机动车所有人可以委托代理人代理申请()。

选项A：共同所有人变更。这个选项指的是机动车所有权的共有人之间进行的变更，通常需要所有共有人共同办理或提供同意变更的证明，不一定能委托代理人办理。

选项B：申请补领机动车登记证书。虽然一些程序可以通过代理人进行，但补领机动车登记证书往往需要车主本人提供身份证明等材料，以确保安全性，通常不通过代理人办理。

选项C：转让登记。机动车转让登记是一个可以委托代理人的过程。机动车所有人可以授权代理人办理车辆过户手续，包括办理相关证明文件和完成登记手续。

选项D：机动车灭失注销。通常情况下，机动车灭失注销需要车主本人提供相关证明，如报警证明等，以证实车辆灭失的情况，这一过程一般不通过代理人办理。

为什么选择C：根据《机动车登记规定》，机动车所有人可以委托代理人代理申请机动车转让登记。因此，在上述选项中，只有转让登记（选项C）是可以由代理人代表车主办理的。所以正确答案是C。