2.1.69已注册登记的机动车有(),机动车所有人应当向登记地车辆管理所申请变更登记。

选项A：小型、微型载客汽车加装出入口踏步件。这一选项描述的是对车辆进行的一种小型改动，通常这种改动不需要进行变更登记，因为它不影响车辆的基本属性和安全性能。

选项B：货运机动车加装防风罩、水箱、工具箱、备胎架等。这些加装通常是为了提高车辆的功能性或保护车辆，但它们也不改变车辆的基本用途和结构，因此通常不需要进行变更登记。

选项C：使用性质改变的。这个选项指的是机动车的使用性质发生了变化，例如从非营运车辆变为营运车辆，或者从营运车辆变为非营运车辆。这种变化会影响到车辆的分类、使用年限、税费征收等多个方面，因此需要向车辆管理所申请变更登记。

选项D：增加机动车车内装饰。对车辆进行内饰装饰通常属于车主的个人喜好，这种改动不会影响车辆的使用性质和基本结构，所以不需要进行变更登记。

答案：C。因为根据《机动车登记规定》，当机动车的使用性质发生改变时，机动车所有人应当向登记地车辆管理所申请变更登记。选项C中提到的“使用性质改变的”正是指这种情况，所以正确答案是C。其他选项虽然涉及对车辆的改动，但都不涉及使用性质的改变，因此不需要进行变更登记。