2.1.66办理()驾驶证业务时,提交的身体条件证明应当由经省级卫生健康行政部门认定的专门医疗机构出具。

选项解析：

A. 大型客车：大型客车驾驶员需要具备一定的身体条件，但并不是专门针对身体条件有特殊要求的驾驶证业务。

B. 重型牵引挂车：同大型客车，驾驶员需满足一定的身体条件，但不是本题关注点。

C. 城市公交车：城市公交车驾驶员的身体条件也有一定要求，但并非特别针对残疾人。

D. 残疾人专用小型自动挡载客汽车：这个选项是针对有特殊身体条件的驾驶员，即残疾人。根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，残疾人申请驾驶证时，需要提交由省级卫生健康行政部门认定的专门医疗机构出具的身体条件证明。

答案解析：

选择D，因为残疾人专用小型自动挡载客汽车的驾驶证业务与普通驾驶证业务不同，需要特别注意申请人的身体条件。残疾人申请驾驶证时，必须提交由专门医疗机构出具的身体条件证明，以确保申请人具备安全驾驶的身体条件。其他选项虽然也有身体条件要求，但不是专门针对残疾人群体，因此不需要专门医疗机构出具的身体条件证明。