2.1.61车辆管理所在办理驾驶证核发及相关业务过程中发现存在()情形的,应当及时开展调查。

选项A：涉嫌使用伪造、变造的机动车驾驶证的。这种情况涉及到违法行为，车辆管理所必须及时调查，以确保驾驶证的真实性和合法性，维护正常的交通管理秩序。

选项B：存在短期内频繁补换领、转出转入驾驶证等异常情形的。这种异常行为可能表明驾驶证被用于不正当目的，比如套牌、洗分等，因此需要调查以防止违规行为。

选项C：涉嫌提交虚假申请材料的。提交虚假材料是违反机动车驾驶证申领规定的，这种行为可能导致驾驶证的发放出现问题，需要调查以确保驾驶证核发过程的公正性和严肃性。

选项D：以上都需要。这个选项包含了A、B、C三种情况，都是车辆管理所在办理驾驶证核发及相关业务过程中需要及时开展调查的严重情形。因此，选项D是正确的答案。

选择D的原因是，车辆管理所在办理驾驶证核发及相关业务过程中，对于任何可能影响驾驶证真实性和合法性的情况都应该保持高度警惕，及时开展调查。这不仅是对法律的遵守，也是对公共安全的负责。选项D涵盖了所有可能违法或违规的情形，因此是正确答案。