2.1.58校车行驶线路、开行时间、停靠站点发生变化的,经()批准后,应当按照规定重新领取校车标牌。

选项解析：

A. 省级人民政府：这一选项不正确，因为校车行驶线路、开行时间、停靠站点发生变化时，不需要经过省级人民政府的批准。

B. 省级教育行政部门：同样，这一选项也不正确，省级教育行政部门不负责具体校车标牌的审批工作。

C. 县级或者设区的市级人民政府：这一选项正确。根据《校车安全管理条例》，校车行驶线路、开行时间、停靠站点发生变化时，应当由县级或者设区的市级人民政府进行审批，审批通过后，需重新领取校车标牌。

D. 县级或者设区的市级教育行政部门：这一选项不正确，虽然教育行政部门与学校相关，但具体审批权限不在教育行政部门。

为什么选这个答案：

选择C是因为根据《校车安全管理条例》的规定，校车行驶线路、开行时间、停靠站点发生变化，属于地方政府的管理职责范围，应由县级或者设区的市级人民政府批准。这样的规定可以确保校车运行的合法性和安全性，同时便于地方政府进行有效监管。