HXD1电力机车在主断路器和高压穿墙套管之间，装有过电压保护用氧化锌避雷器，可以对雷击过电压和操作过电压起保护作用。

HXD3电力机车当某一套辅助变流器发生故障时，允许操纵端压缩机可以投入工作。

HXD3电力机车辅助变流器通过由IGBT构成的整流器单元把从主变压器辅助绕组提供的单相交流电转换为恒定电压的直流电，而后通过由IGBT构成的逆变器单元把直流电转换为三相交流电。

HXD3电力机车当任何一组辅助变流器出现故障时，通过微机控制监视系统的信息传递和故障切换，可以实现由另一组辅助变流器以CVCF方式对部分辅助机组供电。

HXD3电力机车釆用VVVF控制方式的UA11根据机车的运转状态不同，而输出的380 V交流电采用不同的频率。机车手柄级位为4级（含4级）以下运行时频率为33Hz，4级以上时频率为50Hz。

HXD3型电力机车辅助电气系统分别提供VVVF 和 CVCF三相辅助电源，对辅助机组进行分类供电。

HXD3型电力机车辅助电气系统采用两组辅助变流器。

HXD3型电力机车辅助变流器UA11、UA12内部，分别设有2套接地保护装置。

HXD3电力机车无论是整流器单元还是逆变器单元均采用PWM调制方式进行控制。

HXD3型电力机车每组辅助变流器，均可向110V充电模块提供DC350电源。

HXD3型电力机车辅助变流器采用软起动方式进行起动，除空气压缩机电动机外，其他辅助电动机也随之起动。