117.政府投资建设的农田水利工程由( )组织竣工验收,并邀请有关专家和农村集体经济组织、农民用水合作组织、农民代表参加。

本题考察的是政府投资建设的农田水利工程竣工验收的组织者。

选项A，乡镇人民政府：虽然乡镇人民政府在地方事务中扮演重要角色，但政府投资建设的农田水利工程，其竣工验收通常不会由乡镇人民政府直接组织，因为这类工程往往涉及更高层次的管理和审批，故A错误。

选项B，农田水利工程所有权人：农田水利工程的所有权人可能是多元化的，包括国家、集体或私人等。然而，在政府投资建设的农田水利工程中，所有权人并不直接负责竣工验收的组织工作，这通常由政府部门或相关机构负责，故B错误。

选项C，水行政主管部门：水行政主管部门确实在水利工程管理中扮演重要角色，但政府投资建设的农田水利工程竣工验收通常不会仅由水行政主管部门单独组织。这类工程的竣工验收往往需要多个部门的参与和协调，以确保工程质量和合规性，故C错误。

选项D，县级以上人民政府有关部门：政府投资建设的农田水利工程，其竣工验收应由县级以上人民政府的有关部门（如水利、财政、农业等部门）共同组织，并邀请相关专家和利益相关方（如农村集体经济组织、农民用水合作组织、农民代表）参加。这种组织方式可以确保工程竣工验收的全面性、公正性和透明度，故D正确。

综上所述，正确答案是D。