以下情形不属于《上海市建设工程安全生产责任保险实施意见》规定的保险责任的有（）。

首先，让我们来看一下《上海市建设工程安全生产责任保险实施意见》规定的保险责任包括哪些情形。根据题目，以下情形不属于保险责任：
A:被责令停产、停业、关闭后擅自从事经营活动发生的事故
B:投保单位或其从业人员或者第三者故意行为造成的生产安全事故
C:违法行为造成的生产安全事故
D:不可抗力造成的生产安全事故
E:间接损失
现在让我们逐个分析这些选项。
A选项表示被责令停产、停业、关闭后擅自从事经营活动发生的事故，这种情形不属于保险责任。这是因为投保单位擅自从事经营活动，属于违规行为，保险公司通常不承担这种情况下的责任。
B选项表示投保单位或其从业人员或者第三者故意行为造成的生产安全事故，这也不属于保险责任。因为保险通常不承担故意造成的损失。
C选项表示违法行为造成的生产安全事故，同样不属于保险责任。因为保险通常不承担违法行为造成的损失。
D选项表示不可抗力造成的生产安全事故，这也不属于保险责任。因为不可抗力是指无法预见、避免和克服的客观情况，保险通常不承担这种情况下的责任。
E选项表示间接损失，这同样不属于保险责任。因为保险通常只承担直接损失，而不承担间接损失。
因此，根据题目要求，正确答案是ABCDE。希望以上解析能够帮助你理解这道题目。