《行规》轮缘原设计厚度在25mm及以下的机车，原则上不得经国铁线路运行

HXD3D型电力机车机车设有一个低压电源柜（含控制电源装置 PSU 和蓄电池柜）提供机车所需的 DC110V 控制电源，同时控制电源柜中的功率单元还完成向蓄电池组充电。

HXD3D型电力机车机车进入“停车位置”模式，在 3 分钟内，电钥匙可以拔出，微机控制系统仍然有电，此时司机可进行换端操作。换端后将电钥匙置于"合"位，然后按下“停车位置”按钮，可退出“停车位置”模式。如果 3 分钟内，司机没有进行任何操作，微机控制系统将发出断主断、降弓指令。

HXD3D型电力机车机车进入“定速控制”状态后，司机控制器调速手柄的级位变化超过 1 级以上时，机车“定速控制”状态自动解除。再次按下“定速控制”按钮也能退出“定速控制”状态。

HXD3D型电力机车机车还设有一个外接的蓄电池充电插座 XSC3。当蓄电池组馈电严重，低于机车电器的最低控制电压，不能保证功率单元正常工作时，可以通过该插座向蓄电池进行充电；也可以作为机车调试检修时外接控制电源的引入插座。

HXD3D型电力机车机车辅助加热回路中，还设有低温预热回路，最初采用 DC110V 低温预热，机车一旦可以升弓合主断，辅助变流器工作后，就转由 DC110V 进行低温预热。

HXD3D型电力机车机车的司机控制器调速手柄在牵引模式下级位设定为 17 级。

HXD3D型电力机车机车采用 2 个容积均为800L 的风缸串联作为压缩空气的储存容器，风缸采用车内立式安装。

HXD3D型电力机车供电钥匙开关有两个位置：“断”、“合”位。当置“合”位置时，向供电柜发出供电指令。

HXD3D型电力机车辅助变流器的故障转换控制由机车微机控制系统（TCMS）自动完成。

HXD3D型电力机车电制动方式为电阻制动。