假设甲使用完的避孕套被收缴，经公安机关批准后，可以作以下哪种处理？（）

选项A：“应当及时返回物品持有人” —— 这个选项在一般情况下可能是正确的，但是对于使用过的避孕套这种个人隐私物品，不适合返还给持有人，因为这可能涉及个人隐私和卫生问题。

选项B：“依法变卖或者拍卖，将所得款项上缴国库” —— 这个选项通常适用于可以被变卖或拍卖的物品，如违禁品、赃物等。然而，使用过的避孕套不适合变卖或拍卖，因为它不仅没有经济价值，还可能存在健康风险。

选项C：“统一登记造册后予以销毁” —— 这个选项是正确的。对于使用过的避孕套这种可能含有有害物质或疾病的个人物品，应当进行统一登记，以确保物品得到妥善处理，然后销毁以避免传播疾病和保护个人隐私。

选项D：“由县级以上公安机关主管部门组织销毁” —— 虽然表面上看似合理，但是这个选项没有提到“统一登记造册”的步骤，这是物品销毁前的一个重要程序，以确保物品处理的透明性和可追溯性。

因此，正确答案是C。这是因为选项C提到了对这类物品进行合理和规范的处理的必要步骤，即统一登记造册后销毁，这符合公安机关处理此类物品的规定和程序，既保护了个人隐私，也避免了可能的健康风险。