安全生产检查的内容包括：软件系统和硬件系统。软件系统主要是( )。

解析：软件系统主要是指管理制度、管理措施等软性方面的内容。具体来说，查制度是指检查企业是否建立了完善的安全生产管理制度，是否有明确的责任分工和操作流程；查管理是指检查企业是否严格执行相关安全管理制度，是否有有效的安全管理措施和监督措施。因此，正确答案是BCD。

举例来说，如果一个企业只是口头上有安全管理制度，但实际操作中并没有得到有效执行，那么即使有完善的硬件设施，也无法保障安全生产。就好比一台电脑有了最先进的硬件配置，但没有安装合适的软件系统，也无法正常运行一样。因此，软件系统的重要性不容忽视。