6.员工患有重大疾病或连续病休( )及以上的，医疗期终结需要返岗工作的，须本人提出书面申请，必须经市级及以上医院及劳动能力鉴定机构出具可工作证明后方可返岗工作。重大疾病的认定以航卫中心的认定标准为准。

这是一道关于员工病假管理的问题，需要分析员工在患有重大疾病或连续病休多长时间后，医疗期结束并希望返回工作岗位时，所需遵循的规定。

首先，理解问题的关键点：员工在重大疾病或长时间病休后，如何被允许返回工作岗位。题目描述了一个具体的过程，即员工需要提出书面申请，并必须经市级及以上医院及劳动能力鉴定机构出具可工作证明。

接下来，分析各个选项：

A选项（一个月）：这个时间过短，不符合一般医疗期和病假管理的常规做法，因此不太可能是正确答案。
B选项（两个月）：虽然比一个月长，但在实际的人力资源管理中，两个月的病假后直接要求市级及以上医院证明可能不是标准做法，特别是在涉及重大疾病时。
C选项（三个月）：这个时间长度更符合一般的企业病假管理和医疗期规定。在许多公司政策和劳动法规定中，连续病休超过一定期限（如三个月）后，确实需要更严格的医疗证明来确认员工是否适合返回工作岗位。
D选项（六个月）：虽然六个月也是一个常见的病假期限，但在本题中，考虑到“重大疾病”这一特定条件，以及题目中强调的“必须经市级及以上医院及劳动能力鉴定机构出具可工作证明”，三个月可能是一个更为合理且常见的阈值，用于触发这种严格的返岗程序。

最后，根据题目描述和选项分析，C选项（三个月）最符合逻辑和实际情况。这是因为三个月的连续病休对于员工和雇主都是一个重要的时间点，需要更谨慎地评估员工的健康状况和工作能力。

因此，答案是C（三个月）。